Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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ZBED1O96006 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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