Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIOO75962 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIOO75962 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIOO75962 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIOO75962 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIOO75962 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIOO75962 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIOO75962 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIOO75962 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIOO75962 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIOO75962 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIOO75962 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIOO75962 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIOO75962 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIOO75962 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIOO75962 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIOO75962 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIOO75962 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIOO75962 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIOO75962 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIOO75962 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIOO75962 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIOO75962 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIOO75962 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIOO75962 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIOO75962 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIOO75962 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIOO75962 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIOO75962 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIOO75962 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIOO75962 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIOO75962 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIOO75962 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIOO75962 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIOO75962 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIOO75962 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIOO75962 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIOO75962 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIOO75962 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIOO75962 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIOO75962 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIOO75962 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIOO75962 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIOO75962 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIOO75962 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIOO75962 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIOO75962 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIOO75962 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIOO75962 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIOO75962 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIOO75962 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIOO75962 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIOO75962 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIOO75962 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIOO75962 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIOO75962 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIOO75962 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIOO75962 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIOO75962 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIOO75962 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIOO75962 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIOO75962 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIOO75962 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIOO75962 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIOO75962 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIOO75962 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIOO75962 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIOO75962 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIOO75962 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIOO75962 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIOO75962 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIOO75962 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIOO75962 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIOO75962 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIOO75962 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIOO75962 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIOO75962 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIOO75962 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIOO75962 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIOO75962 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIOO75962 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIOO75962 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIOO75962 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIOO75962 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIOO75962 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIOO75962 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIOO75962 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIOO75962 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIOO75962 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIOO75962 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIOO75962 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIOO75962 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIOO75962 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIOO75962 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIOO75962 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIOO75962 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIOO75962 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIOO75962 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIOO75962 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIOO75962 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms