Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
E9PCH4 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
E9PCH4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E9PCH4 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E9PCH4 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
E9PCH4 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E9PCH4 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
E9PCH4 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
E9PCH4 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
E9PCH4 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
E9PCH4 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
E9PCH4 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E9PCH4 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
E9PCH4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
E9PCH4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E9PCH4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
E9PCH4 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
E9PCH4 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E9PCH4 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
E9PCH4 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E9PCH4 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E9PCH4 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E9PCH4 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
E9PCH4 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PCH4 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PCH4 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PCH4 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PCH4 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PCH4 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PCH4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PCH4 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PCH4 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PCH4 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PCH4 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PCH4 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PCH4 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PCH4 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PCH4 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PCH4 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PCH4 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PCH4 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PCH4 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PCH4 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PCH4 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PCH4 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PCH4 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PCH4 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PCH4 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PCH4 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PCH4 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PCH4 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PCH4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PCH4 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PCH4 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PCH4 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PCH4 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PCH4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PCH4 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PCH4 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E9PCH4 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E9PCH4 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E9PCH4 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E9PCH4 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E9PCH4 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E9PCH4 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E9PCH4 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E9PCH4 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E9PCH4 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E9PCH4 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E9PCH4 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E9PCH4 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E9PCH4 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E9PCH4 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E9PCH4 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
E9PCH4 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E9PCH4 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E9PCH4 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E9PCH4 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
E9PCH4 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
E9PCH4 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E9PCH4 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E9PCH4 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E9PCH4 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E9PCH4 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E9PCH4 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E9PCH4 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E9PCH4 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
E9PCH4 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
E9PCH4 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
E9PCH4 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
E9PCH4 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
E9PCH4 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
E9PCH4 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
E9PCH4 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
E9PCH4 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
E9PCH4 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
E9PCH4 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
E9PCH4 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
E9PCH4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
E9PCH4 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms