Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms