Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XIRP2A4UGR9 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms