Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIPSLA2A3N6 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms