Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVW-1Q9UQF0 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms