Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV3

MID2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID2Q9UJV3 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MID2Q9UJV3 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms