Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLKQ9UBT6 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLKQ9UBT6 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLKQ9UBT6 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLKQ9UBT6 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLKQ9UBT6 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLKQ9UBT6 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLKQ9UBT6 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLKQ9UBT6 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLKQ9UBT6 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLKQ9UBT6 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
POLKQ9UBT6 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLKQ9UBT6 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLKQ9UBT6 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLKQ9UBT6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLKQ9UBT6 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLKQ9UBT6 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLKQ9UBT6 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLKQ9UBT6 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
POLKQ9UBT6 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLKQ9UBT6 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLKQ9UBT6 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLKQ9UBT6 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLKQ9UBT6 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLKQ9UBT6 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLKQ9UBT6 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
POLKQ9UBT6 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
POLKQ9UBT6 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
POLKQ9UBT6 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
POLKQ9UBT6 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
POLKQ9UBT6 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
POLKQ9UBT6 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
POLKQ9UBT6 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
POLKQ9UBT6 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms