Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
REREQ9P2R6 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
REREQ9P2R6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
REREQ9P2R6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
REREQ9P2R6 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
REREQ9P2R6 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
REREQ9P2R6 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
REREQ9P2R6 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
REREQ9P2R6 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
REREQ9P2R6 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
REREQ9P2R6 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
REREQ9P2R6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
REREQ9P2R6 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
REREQ9P2R6 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
REREQ9P2R6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
REREQ9P2R6 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
REREQ9P2R6 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
REREQ9P2R6 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
REREQ9P2R6 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
REREQ9P2R6 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
REREQ9P2R6 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
REREQ9P2R6 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
REREQ9P2R6 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
REREQ9P2R6 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
REREQ9P2R6 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
REREQ9P2R6 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
REREQ9P2R6 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
REREQ9P2R6 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
REREQ9P2R6 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
REREQ9P2R6 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
REREQ9P2R6 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
REREQ9P2R6 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
REREQ9P2R6 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
REREQ9P2R6 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
REREQ9P2R6 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
REREQ9P2R6 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
REREQ9P2R6 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
REREQ9P2R6 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
REREQ9P2R6 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
REREQ9P2R6 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
REREQ9P2R6 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
REREQ9P2R6 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
REREQ9P2R6 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
REREQ9P2R6 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
REREQ9P2R6 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
REREQ9P2R6 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
REREQ9P2R6 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
REREQ9P2R6 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
REREQ9P2R6 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
REREQ9P2R6 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
REREQ9P2R6 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
REREQ9P2R6 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
REREQ9P2R6 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
REREQ9P2R6 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
REREQ9P2R6 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
REREQ9P2R6 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
REREQ9P2R6 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
REREQ9P2R6 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
REREQ9P2R6 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms