Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6H4

REEP4, Receptor expression-enhancing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP4Q9H6H4 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.06■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.06■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
REEP4Q9H6H4 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.05■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.05■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.05■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.05■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.05■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.04■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
REEP4Q9H6H4 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms