Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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IFT27Q9BW83 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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IFT27Q9BW83 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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IFT27Q9BW83 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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IFT27Q9BW83 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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IFT27Q9BW83 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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IFT27Q9BW83 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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IFT27Q9BW83 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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