Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EBF4Q9BQW3 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms