Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG2BQ96BY7 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms