Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY2

EME1, Crossover junction endonuclease EME1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME1Q96AY2 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EME1Q96AY2 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EME1Q96AY2 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EME1Q96AY2 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EME1Q96AY2 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EME1Q96AY2 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EME1Q96AY2 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EME1Q96AY2 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EME1Q96AY2 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EME1Q96AY2 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EME1Q96AY2 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EME1Q96AY2 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EME1Q96AY2 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EME1Q96AY2 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EME1Q96AY2 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EME1Q96AY2 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EME1Q96AY2 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EME1Q96AY2 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EME1Q96AY2 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EME1Q96AY2 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EME1Q96AY2 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EME1Q96AY2 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EME1Q96AY2 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EME1Q96AY2 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EME1Q96AY2 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EME1Q96AY2 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EME1Q96AY2 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EME1Q96AY2 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EME1Q96AY2 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EME1Q96AY2 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EME1Q96AY2 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EME1Q96AY2 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EME1Q96AY2 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EME1Q96AY2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EME1Q96AY2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EME1Q96AY2 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EME1Q96AY2 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EME1Q96AY2 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EME1Q96AY2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EME1Q96AY2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EME1Q96AY2 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EME1Q96AY2 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EME1Q96AY2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EME1Q96AY2 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EME1Q96AY2 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EME1Q96AY2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EME1Q96AY2 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EME1Q96AY2 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EME1Q96AY2 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EME1Q96AY2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EME1Q96AY2 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EME1Q96AY2 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EME1Q96AY2 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EME1Q96AY2 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EME1Q96AY2 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EME1Q96AY2 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EME1Q96AY2 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EME1Q96AY2 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EME1Q96AY2 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EME1Q96AY2 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EME1Q96AY2 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EME1Q96AY2 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EME1Q96AY2 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EME1Q96AY2 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EME1Q96AY2 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EME1Q96AY2 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EME1Q96AY2 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EME1Q96AY2 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EME1Q96AY2 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EME1Q96AY2 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EME1Q96AY2 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EME1Q96AY2 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EME1Q96AY2 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EME1Q96AY2 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EME1Q96AY2 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EME1Q96AY2 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EME1Q96AY2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.02■□□□□ -0
EME1Q96AY2 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EME1Q96AY2 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EME1Q96AY2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EME1Q96AY2 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EME1Q96AY2 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EME1Q96AY2 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EME1Q96AY2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EME1Q96AY2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EME1Q96AY2 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EME1Q96AY2 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EME1Q96AY2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EME1Q96AY2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EME1Q96AY2 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EME1Q96AY2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EME1Q96AY2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EME1Q96AY2 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
EME1Q96AY2 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.02■□□□□ -0
EME1Q96AY2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.02■□□□□ -0
EME1Q96AY2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EME1Q96AY2 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.02■□□□□ -0
EME1Q96AY2 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
EME1Q96AY2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
EME1Q96AY2 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms