Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms