Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms