Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK8

FAM46D, Putative nucleotidyltransferase FAM46D, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46DQ8NEK8 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM46DQ8NEK8 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM46DQ8NEK8 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM46DQ8NEK8 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM46DQ8NEK8 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM46DQ8NEK8 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM46DQ8NEK8 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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FAM46DQ8NEK8 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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FAM46DQ8NEK8 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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FAM46DQ8NEK8 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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FAM46DQ8NEK8 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM46DQ8NEK8 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM46DQ8NEK8 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM46DQ8NEK8 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM46DQ8NEK8 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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FAM46DQ8NEK8 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM46DQ8NEK8 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM46DQ8NEK8 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM46DQ8NEK8 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM46DQ8NEK8 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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FAM46DQ8NEK8 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM46DQ8NEK8 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM46DQ8NEK8 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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FAM46DQ8NEK8 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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FAM46DQ8NEK8 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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FAM46DQ8NEK8 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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FAM46DQ8NEK8 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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FAM46DQ8NEK8 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM46DQ8NEK8 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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FAM46DQ8NEK8 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM46DQ8NEK8 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM46DQ8NEK8 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM46DQ8NEK8 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM46DQ8NEK8 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM46DQ8NEK8 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM46DQ8NEK8 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM46DQ8NEK8 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM46DQ8NEK8 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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FAM46DQ8NEK8 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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FAM46DQ8NEK8 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM46DQ8NEK8 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM46DQ8NEK8 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM46DQ8NEK8 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM46DQ8NEK8 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM46DQ8NEK8 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM46DQ8NEK8 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM46DQ8NEK8 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM46DQ8NEK8 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM46DQ8NEK8 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM46DQ8NEK8 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM46DQ8NEK8 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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