Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms