Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms