Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED27Q6P2C8 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED27Q6P2C8 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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