Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 682.2 ms