Protein–RNA interactions for Protein: Q5FBB7

SGO1, Shugoshin 1, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO1Q5FBB7 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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SGO1Q5FBB7 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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SGO1Q5FBB7 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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SGO1Q5FBB7 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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SGO1Q5FBB7 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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SGO1Q5FBB7 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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SGO1Q5FBB7 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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SGO1Q5FBB7 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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