Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms