Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms