Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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