Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GEN1Q17RS7 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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GEN1Q17RS7 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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GEN1Q17RS7 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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GEN1Q17RS7 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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GEN1Q17RS7 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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GEN1Q17RS7 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
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GEN1Q17RS7 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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GEN1Q17RS7 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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GEN1Q17RS7 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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