Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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