Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms