Protein–RNA interactions for Protein: Q15828

CST6, Cystatin-M, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST6Q15828 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CST6Q15828 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CST6Q15828 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CST6Q15828 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CST6Q15828 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CST6Q15828 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CST6Q15828 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CST6Q15828 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CST6Q15828 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CST6Q15828 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CST6Q15828 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CST6Q15828 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CST6Q15828 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CST6Q15828 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CST6Q15828 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CST6Q15828 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CST6Q15828 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CST6Q15828 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CST6Q15828 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CST6Q15828 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CST6Q15828 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CST6Q15828 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CST6Q15828 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CST6Q15828 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CST6Q15828 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CST6Q15828 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CST6Q15828 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CST6Q15828 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CST6Q15828 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CST6Q15828 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CST6Q15828 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CST6Q15828 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CST6Q15828 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CST6Q15828 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CST6Q15828 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CST6Q15828 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CST6Q15828 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CST6Q15828 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CST6Q15828 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CST6Q15828 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CST6Q15828 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CST6Q15828 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CST6Q15828 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CST6Q15828 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CST6Q15828 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CST6Q15828 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CST6Q15828 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CST6Q15828 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CST6Q15828 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CST6Q15828 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CST6Q15828 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CST6Q15828 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CST6Q15828 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CST6Q15828 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CST6Q15828 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CST6Q15828 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CST6Q15828 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CST6Q15828 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CST6Q15828 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CST6Q15828 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CST6Q15828 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CST6Q15828 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CST6Q15828 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CST6Q15828 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CST6Q15828 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CST6Q15828 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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CST6Q15828 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CST6Q15828 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CST6Q15828 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CST6Q15828 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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CST6Q15828 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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CST6Q15828 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CST6Q15828 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CST6Q15828 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CST6Q15828 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CST6Q15828 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CST6Q15828 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CST6Q15828 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CST6Q15828 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CST6Q15828 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CST6Q15828 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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CST6Q15828 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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CST6Q15828 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CST6Q15828 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CST6Q15828 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CST6Q15828 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CST6Q15828 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CST6Q15828 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CST6Q15828 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CST6Q15828 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CST6Q15828 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CST6Q15828 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CST6Q15828 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
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