Protein–RNA interactions for Protein: Q15464

SHB, SH2 domain-containing adapter protein B, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBQ15464 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHBQ15464 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHBQ15464 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHBQ15464 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHBQ15464 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHBQ15464 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHBQ15464 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHBQ15464 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHBQ15464 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHBQ15464 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHBQ15464 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SHBQ15464 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHBQ15464 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHBQ15464 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHBQ15464 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHBQ15464 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SHBQ15464 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SHBQ15464 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHBQ15464 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHBQ15464 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHBQ15464 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHBQ15464 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHBQ15464 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHBQ15464 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHBQ15464 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHBQ15464 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHBQ15464 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHBQ15464 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHBQ15464 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHBQ15464 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHBQ15464 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHBQ15464 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHBQ15464 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHBQ15464 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHBQ15464 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHBQ15464 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHBQ15464 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHBQ15464 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHBQ15464 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SHBQ15464 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHBQ15464 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHBQ15464 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHBQ15464 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHBQ15464 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHBQ15464 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SHBQ15464 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHBQ15464 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHBQ15464 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHBQ15464 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHBQ15464 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHBQ15464 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SHBQ15464 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHBQ15464 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHBQ15464 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHBQ15464 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHBQ15464 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHBQ15464 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHBQ15464 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SHBQ15464 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHBQ15464 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SHBQ15464 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SHBQ15464 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHBQ15464 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHBQ15464 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHBQ15464 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHBQ15464 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHBQ15464 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHBQ15464 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHBQ15464 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHBQ15464 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHBQ15464 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHBQ15464 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHBQ15464 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHBQ15464 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHBQ15464 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHBQ15464 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHBQ15464 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHBQ15464 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHBQ15464 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHBQ15464 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHBQ15464 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHBQ15464 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHBQ15464 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHBQ15464 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHBQ15464 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHBQ15464 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHBQ15464 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHBQ15464 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHBQ15464 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHBQ15464 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHBQ15464 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHBQ15464 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHBQ15464 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHBQ15464 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHBQ15464 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHBQ15464 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHBQ15464 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHBQ15464 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHBQ15464 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHBQ15464 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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