Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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SEC23BQ15437 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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SEC23BQ15437 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SEC23BQ15437 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SEC23BQ15437 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC23BQ15437 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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