Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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RAB35Q15286 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
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RAB35Q15286 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
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RAB35Q15286 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
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RAB35Q15286 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB35Q15286 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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RAB35Q15286 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
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RAB35Q15286 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB35Q15286 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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