Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms