Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NFIXQ14938 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
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