Protein–RNA interactions for Protein: Q14094

CCNI, Cyclin-I, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNIQ14094 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNIQ14094 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNIQ14094 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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