Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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TUBA3CQ13748 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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TUBA3CQ13748 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA3CQ13748 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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