Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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