Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL3Q13618 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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