Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM32Q13049 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM32Q13049 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms