Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CSTF3Q12996 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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