Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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PTP4A2Q12974 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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PTP4A2Q12974 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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PTP4A2Q12974 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
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PTP4A2Q12974 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTP4A2Q12974 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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