Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXD4Q12950 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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