Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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