Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
STX4Q12846 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
STX4Q12846 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
STX4Q12846 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
STX4Q12846 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
STX4Q12846 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
STX4Q12846 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
STX4Q12846 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
STX4Q12846 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
STX4Q12846 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
STX4Q12846 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
STX4Q12846 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
STX4Q12846 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
STX4Q12846 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
STX4Q12846 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.07■□□□□ 0
STX4Q12846 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.07■□□□□ 0
STX4Q12846 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
STX4Q12846 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
STX4Q12846 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
STX4Q12846 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.07■□□□□ 0
STX4Q12846 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.07■□□□□ 0
STX4Q12846 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
STX4Q12846 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
STX4Q12846 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
STX4Q12846 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.07■□□□□ 0
STX4Q12846 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
STX4Q12846 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
STX4Q12846 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
STX4Q12846 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
STX4Q12846 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
STX4Q12846 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.07■□□□□ 0
STX4Q12846 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
STX4Q12846 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.07■□□□□ 0
STX4Q12846 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
STX4Q12846 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.07■□□□□ 0
STX4Q12846 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
STX4Q12846 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
STX4Q12846 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
STX4Q12846 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
STX4Q12846 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
STX4Q12846 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
STX4Q12846 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
STX4Q12846 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
STX4Q12846 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.07■□□□□ 0
STX4Q12846 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
STX4Q12846 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
STX4Q12846 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
STX4Q12846 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
STX4Q12846 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
STX4Q12846 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
STX4Q12846 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
STX4Q12846 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.07■□□□□ 0
STX4Q12846 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
STX4Q12846 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
STX4Q12846 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
STX4Q12846 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
STX4Q12846 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
STX4Q12846 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
STX4Q12846 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
STX4Q12846 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
STX4Q12846 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
STX4Q12846 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
STX4Q12846 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
STX4Q12846 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.06■□□□□ 0
STX4Q12846 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
STX4Q12846 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
STX4Q12846 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.06■□□□□ 0
STX4Q12846 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
STX4Q12846 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.06■□□□□ 0
STX4Q12846 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
STX4Q12846 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
STX4Q12846 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
STX4Q12846 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
STX4Q12846 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
STX4Q12846 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.06■□□□□ 0
STX4Q12846 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
STX4Q12846 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
STX4Q12846 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
STX4Q12846 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
STX4Q12846 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
STX4Q12846 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
STX4Q12846 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
STX4Q12846 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
STX4Q12846 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.06■□□□□ 0
STX4Q12846 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
STX4Q12846 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
STX4Q12846 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
STX4Q12846 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
STX4Q12846 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
STX4Q12846 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
STX4Q12846 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
STX4Q12846 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
STX4Q12846 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
STX4Q12846 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
STX4Q12846 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
STX4Q12846 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
STX4Q12846 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
STX4Q12846 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
STX4Q12846 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
STX4Q12846 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms