Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TROQ12816 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TROQ12816 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TROQ12816 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TROQ12816 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TROQ12816 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TROQ12816 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TROQ12816 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TROQ12816 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TROQ12816 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TROQ12816 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TROQ12816 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TROQ12816 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TROQ12816 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TROQ12816 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TROQ12816 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TROQ12816 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TROQ12816 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TROQ12816 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TROQ12816 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TROQ12816 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TROQ12816 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TROQ12816 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TROQ12816 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TROQ12816 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TROQ12816 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TROQ12816 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TROQ12816 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TROQ12816 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TROQ12816 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TROQ12816 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TROQ12816 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TROQ12816 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TROQ12816 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TROQ12816 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TROQ12816 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TROQ12816 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TROQ12816 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TROQ12816 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TROQ12816 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TROQ12816 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TROQ12816 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TROQ12816 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TROQ12816 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TROQ12816 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TROQ12816 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TROQ12816 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TROQ12816 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TROQ12816 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TROQ12816 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TROQ12816 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TROQ12816 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TROQ12816 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TROQ12816 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TROQ12816 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TROQ12816 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TROQ12816 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TROQ12816 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TROQ12816 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TROQ12816 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TROQ12816 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TROQ12816 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TROQ12816 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TROQ12816 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TROQ12816 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TROQ12816 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TROQ12816 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TROQ12816 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TROQ12816 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TROQ12816 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TROQ12816 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TROQ12816 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TROQ12816 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TROQ12816 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TROQ12816 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TROQ12816 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TROQ12816 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TROQ12816 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TROQ12816 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TROQ12816 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TROQ12816 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TROQ12816 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TROQ12816 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TROQ12816 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TROQ12816 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TROQ12816 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TROQ12816 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TROQ12816 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TROQ12816 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TROQ12816 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TROQ12816 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TROQ12816 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TROQ12816 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TROQ12816 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TROQ12816 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TROQ12816 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TROQ12816 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TROQ12816 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TROQ12816 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TROQ12816 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
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