Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
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