Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLFN5Q08AF3 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms