Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms