Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FMODQ06828 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FMODQ06828 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FMODQ06828 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FMODQ06828 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FMODQ06828 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FMODQ06828 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FMODQ06828 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FMODQ06828 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FMODQ06828 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FMODQ06828 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FMODQ06828 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FMODQ06828 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FMODQ06828 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FMODQ06828 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FMODQ06828 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FMODQ06828 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FMODQ06828 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FMODQ06828 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FMODQ06828 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FMODQ06828 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FMODQ06828 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FMODQ06828 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FMODQ06828 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FMODQ06828 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FMODQ06828 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FMODQ06828 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FMODQ06828 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FMODQ06828 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FMODQ06828 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FMODQ06828 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FMODQ06828 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FMODQ06828 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FMODQ06828 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FMODQ06828 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FMODQ06828 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FMODQ06828 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FMODQ06828 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FMODQ06828 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
FMODQ06828 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
FMODQ06828 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
FMODQ06828 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FMODQ06828 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FMODQ06828 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FMODQ06828 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
FMODQ06828 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FMODQ06828 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FMODQ06828 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FMODQ06828 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FMODQ06828 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FMODQ06828 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
FMODQ06828 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FMODQ06828 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FMODQ06828 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FMODQ06828 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FMODQ06828 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FMODQ06828 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FMODQ06828 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FMODQ06828 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FMODQ06828 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FMODQ06828 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FMODQ06828 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FMODQ06828 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FMODQ06828 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FMODQ06828 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FMODQ06828 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FMODQ06828 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FMODQ06828 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FMODQ06828 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FMODQ06828 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FMODQ06828 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FMODQ06828 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FMODQ06828 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FMODQ06828 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FMODQ06828 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FMODQ06828 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FMODQ06828 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FMODQ06828 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FMODQ06828 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FMODQ06828 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FMODQ06828 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FMODQ06828 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FMODQ06828 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FMODQ06828 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FMODQ06828 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FMODQ06828 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FMODQ06828 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FMODQ06828 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FMODQ06828 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FMODQ06828 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FMODQ06828 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FMODQ06828 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
FMODQ06828 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FMODQ06828 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FMODQ06828 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
FMODQ06828 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FMODQ06828 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FMODQ06828 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FMODQ06828 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FMODQ06828 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms